Vers la fin de la période d'Edo, le Japon a rencontré une crise sans précédent avec les bateaux noirs des autres pays ayant forcé son ouverture. Cependant un robot géant nommé Onigami, qui a existé depuis des temps anciens annihile les bateaux occidentaux, ce qui permet d'exclure les étrangers du pays. L'histoire commence dans un Japon où la restauration de Meji en 1863 n'a pas eu lieu.